Việc treo cờ hai nước hoặc Quốc kỳ Việt Nam và cờ của tổ chức quốc tế phải tuân thủ theo quy định của từng quốc gia, quy định của tổ chức quốc tế và thông lệ quốc tế.
Trong trường hợp nước tiếp nhận quy định treo Quốc kỳ nước tiếp nhận tại Trụ sở Cơ quan đại diện, Văn phòng trực thuộc hoặc nhà riêng khi Nguyên thủ Quốc gia, người đứng đầu Cơ quan hành pháp hoặc lập pháp nước tiếp nhận đến dự các hoạt động đối ngoại tại đó, Quốc kỳ nước tiếp nhận được treo cùng với Quốc kỳ Việt Nam, có kích thước và độ mới tương đương, cách treo, cột treo cờ giống nhau, Quốc kỳ Việt Nam treo bên phải, Quốc kỳ nước tiếp nhận bên trái (theo chiều từ ngoài nhìn vào).
Quốc kỳ nước tiếp nhận được treo lên trước khi khách đến và được hạ xuống sau khi khách rời khỏi.
Nếu theo quy định, thông lệ lễ tân của tổ chức quốc tế tiếp nhận mà trụ sở của Cơ quan đại diện các nước thành viên tại tổ chức quốc tế phải treo cờ của tổ chức quốc tế đó, thì cờ của tổ chức quốc tế được treo cùng với Quốc kỳ Việt Nam.
Đối với ASEAN, Ban Thư ký có hướng dẫn cụ thể về việc treo cờ tại Cơ quan đại diện của các nước thành viên như sau:
Vị trí treo hoặc in cờ hai nước, trước hết phải xác định nước chủ nhà và nước khách. Khi Cơ quan đại diện của Việt Nam tổ chức một sự kiện ở nước sở tại, thì Việt Nam là nước chủ.
Vị trí treo cờ theo thông lệ chung là cờ nước chủ nhà ở bên phải, cờ nước khách ở bên trái theo chiều nhìn từ ngoài vào hoặc từ dưới lên (hình vẽ trên theo cách nhìn này hoặc gọi là nhìn từ ngoài vào). Tuy vậy, một số nước có quy định ngược lại thông lệ này.